1984年开始，学校开展高等中医药自学考试助学工作，先后开设中医学专、本科以及针灸推拿学、中药学专科专业。2002年，国家规定停止自学考试举办医学类专业学历教育，学校不再招生新生，于2008年底完成收尾工作。自1987年至2008年累计毕业2200余人，培养了大批专业领域人才，享有良好声誉。

2014年，为适应天津市经济社会发展对中药学专业人才的需求，学校申请获批成为天津市高等教育自学考试中药学本科专业的主考院校，与天津生物工程职业技术学院合作“高职衔接自考本科”项目，继续教育学院开办中药学本科专业自考助学班。这是通过高等教育自学考试与高等院校资源共享、优势互补完善专科与本科对应衔接课程，搭建高等教育本专科互通式立交桥的高等教育人才培养新模式。

2014年以来，作为主考院校，继续教育学院承担考试科目确定、考试计划制定及考试大纲编写、命题、阅卷、辅导班教学等组织协调工作，加强助学过程管理；天津生物工程职业技术学院负责学生的考籍管理、日常管理、成绩统计等工作。